Penulis Mela Arnani | Editor Rizal Setyo Nugroho
KOMPAS.com – Para ilmuwan di Universitas Teknologi Nanyang (NTU) Singapura mengklaim telah menemukan cara untuk meningkatkan kecepatan memperoleh hasil tes Covid-19 hingga empat kali lipat. Melansir CNA, 27 Juli 2020, metode pengujian disebut dapat menentukan hasil tes dalam 36 menit, sekitar seperempat dari waktu yang dibutuhkan oleh tes standar yang ada.
Baca juga: Indonesia Diperkirakan Butuh Rp25 Triliun-30 Triliun untuk Vaksin Covid-19
Metode pengujian saat ini membutuhkan staf teknis yang sangat terlatih dan dapat memakan waktu beberapa jam sebelum hasilnya selesai. NTU mengatakan, tes dapat dilakukan dengan peralatan portabel dan dapat digunakan di masyarakat sebagai alat skrining. Pengujian merupakan bagian penting dari strategi Pemerintah Singapura untuk mengisolasi dan memagari kasus Covid-19 untuk mencegah pembentukan kelompok besar.
Sejak 1 Juli lalu, individu berusia lebih dari 13 tahun yang datang ke dokter dengan gejala infeksi pernapasan akut akan diuji Covid-19. “Metode baru yang dikembangkan oleh para ilmuwan di Fakultas Kedokteran NTU Lee Kong Chian, telah menunjukkan cara untuk meningkatkan kecepatan, waktu penanganan dan biaya tes laboratorium Covid-19,” tulis keterangan universitas tersebut.
Saat ini, metode pengujian yang paling sensitif untuk virus corona adalah melalui teknik laboratorium yang disebut polymerase chain reaction (PCR), di mana mesin memperkuat materi genetik dengan menyalinnya berulang-ulang sehingga jejak virus corona dapat dideteksi. Lebih lanjut, masalah besar yang saat ini dihadapi adalah memurnikan asam ribonukleat (RNA) dari komponen lain dalam sampel pasien, suatu proses yang membutuhkan bahan kimia, di mana sekarang ini mengalami kekurangan pasokan di seluruh dunia.
“Metode yang dikembangkan oleh NTU LKCMedicine menggabungkan banyak dari langkah-langkah ini dan memungkinkan pengujian langsung pada sampel pasien kasar, mengurangi waktu penyelesaian dari sampel ke hasil, dan menghilangkan kebutuhan untuk bahan kimia pemurnian RNA,” ujar pihak universitas. Tes PCR telah terbukti untuk penelitian biologi tapi memiliki beberapa kelemahan, kata Mr Wee Soon Keong, yang merupakan penulis pertama dari makalah penelitian yang telah diterbitkan dalam jurnal ilmiah Gen.
“Prosesnya memakan waktu. Tes Covid-19 cepat kami melibatkan reaksi tabung tunggal yang mengurangi waktu langsung dan risiko keamanan untuk personel lab, serta kemungkinan kontaminasi sisa selama pemrosesan sampel,” ujar Wee Soon Keong. Metode yang sama jmenurut Wee juga dapat digunakan untuk mendeteksi virus dan bakteri lain, termasuk demam berdarah. Jumlah kasus demam berdarah tahun ini tercatat melampaui 22.170 kasus pada tahun 2013, wabah terburuk di Singapura.
Metode baru
Dalam tes PCR, bahan genetik pada sampel swab harus diekstraksi untuk menghilangkan zat dalam sampel yang mencegah tes bekerja. Salah satu contoh inhibitor adalah musin, komponen utama lendir. Tes yang dirancang oleh tim NTU menggunakan metode PCR langsung, namun menghilangkan kebutuhan untuk pemurnian RNA, langkah yang memakan waktu dan mahal.
Sebagai gantinya, mereka menambahkan enzim dan reagen yang resistan terhadap inhibitor yang menargetkan senyawa yang menghambat amplifikasi RNA, seperti musin. Enzim dan reagen ini memiliki ketahanan tinggi terhadap senyawa yang jika tidak menghambat PCR, membuat tes tidak akurat, tutur universitas menambahkan.
Campuran biokimiawi sampel kasar dan enzim serta reagen yang tahan inhibitor ditempatkan dalam tabung tunggal, yang dimasukkan ke dalam thermocycler laboratorium, sebuah mesin yang digunakan untuk memperkuat materi genetik dalam PCR. Setelah 36 menit, hasilnya mengungkapkan apakah ada jejak Covid-19 atau tidak pada sampel orang yang dites.
Tim juga menguji metode ini pada thermocycler portabel, yang dapat digunakan dalam pengaturan sumber daya rendah dan daerah endemis. Hal itu menunjukkan kemungkinan melakukan tes ini di pengaturan kesehatan masyarakat oleh petugas kesehatan garis depan. “Dengan melewatkan langkah ekstraksi RNA dengan metode PCR langsung kami, kami melihat penghematan biaya pada kit ekstraksi asam nukleat.
Juga menghindari masalah reagen dalam pasokan terbatas ketika pengujian laboratorium meningkat,” kata rekan peneliti senior Dr Sivalingam Paramalingam Suppiah. Associate Professor Eric Yap, pemimpin tim peneliti, mengatakan tim tersebut tengah mencoba untuk menggunakan metode seperti itu untuk diagnosa rutin. “Kita perlu menentukan utilitas dan manfaat yang sebenarnya dalam pengaturan dunia nyata, dan untuk memahami jika ada trade-off,” tuturnya.
Ketika satu hambatan dihilangkan, lanjut dia, tantangan lain mungkin muncul seperti memastikan kontrol kualitas, atau mengurangi kesalahan manual. “Tujuan kami adalah untuk mengembangkan tes ultra-cepat dan otomatis yang menghasilkan hasil dalam hitungan menit, dan itu dapat dilakukan oleh petugas kesehatan di klinik dengan akurasi dan sensitivitas yang sama seperti di laboratorium khusus,” tambahnya. Hal ini akan memungkinkan peneliti untuk mengambil pengujian PCR dari laboratorium konvensional lebih dekat ke titik perawatan, dan ke pengaturan sumber daya rendah yang paling membutuhkan mereka.